摄影图来源:新华网
![购彩](/uploads/aa5e53e5a6423ad0d706ed16519ef4a9.jpeg)
提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
(文图:赵筱尘 巫邓炎)
[责编:天天中]
阅读剩余全文()
视觉焦点
乔治:我爱LA 喜欢和LBJ一起打球
更潮流经济适用男 试驾全新一代起亚K3 1.5L
推荐阅读
购彩 CBA-16连胜!广东现王者风范 新疆0-2被逼上绝境
2024-02-06
购彩12天11板股价疯涨199% 妖股兴齐眼药底气何来
2023-08-08
购彩 国民初恋颜?她这是要复制沈月的走红奇迹了?
2024-02-17
购彩 车企女高管“第一人”郑杰离职 菲亚特克莱斯勒中国区换帅
2023-07-10
购彩30岁男子乘公交刷学生卡 被识破拳打司机
2023-10-18
购彩严屹宽带家人节前出游 小肉肉看天安门认真专注
2023-09-25
购彩续航超320km 奥迪e-tron Sportback假想图曝光
2023-08-05
购彩3岁男童开挖掘机逆行15分钟 亲爹还淡定指导
2023-12-04
购彩"I am made in China"刷屏 刘国梁却这样评价马龙
2023-08-05
购彩晚年欧阳修头戴鲜花游西湖,一首宋词字里行间可见醉翁本色
2023-10-04
购彩日本明仁天皇退位在即 大批民众参观..
2024-03-04
购彩 鹅眼:不缺科幻元素,探秘中国首个火星真实模拟体验基地
2024-01-21
购彩曹喜蛙:优秀美术作品进教材不是一件小事
2023-08-16
购彩《王国之心3》公开后续DLC情报
2023-10-23
购彩《复联4》导演罗素兄弟po
2023-11-04
购彩离婚后给老公留下1080亿美金
2024-04-26
购彩 五一小长假居家旅行必看开运攻略
2024-05-11
购彩听华裔设计大师ANNA SUI解构她的设计哲学
2023-09-25
购彩“癌症之王”胰腺癌的临床表现
2023-12-10
购彩德民众"躺尸"抗议气候变化
2024-05-09
购彩《往日不再》1.05更新修复bug
2024-02-20
购彩 东风日产换帅,安东尼·巴瑟斯将接任总经理
2023-09-23
购彩 博士考高职不是人才"逆流动" 应打破对职教的偏见
2024-05-22
加载更多![](/t2/images/1.gif)
购彩地图
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|